「とりあえずインストール」した後、システムは自動的に再起動され、Microsoft Windows に似たＧＵＩ環境（Graphical User Interface）で利用できます。そのＧＵＩ環境でのログインに使用する「ユーザ名」は、インストール時に「非管理者アカウント」の作成で指定したユーザ名に限られます。

ここではＧＵＩ環境ではなくＣＵＩ環境（Command_line User Interface）でのシステム操作を掲げます。コマンドを発行しながら操作を進めるには、デスクトップ画面上部のメニュー［アプリケーション］→［アクセサリ］→［ＧＮＯＭＥ端末］の順にクリックし、ターミナルウィンドウを開きます。 この操作は Windows の「コマンドプロンプト」環境で操作するのに似ています。

ターミナルウィンドウを開くと、ウィンドウ上に「$」記号（プロンプト記号/コマンド入力促進記号）が表示され、カーソルが点滅し、コマンド入力可能状態になります。ここで「コマンド」とはコンピュータにプログラム実行などを命令・指示する文字列です。

特に設定変更していなければ、DebianGNU/Linux ではプロンプト記号として「$」記号が表示されている状態で入力されたコマンドは「一般ユーザ」（非特権アカウント）の操作要求として実行され、例えば新しいアプリケーションをインストールする等といった操作は実行できません。そういった操作を行うには「特権ユーザ」になる必要があります。

自宅内ＬＡＮ上の WindowsPC など他のＰＣから SSH や telnet などを使って DebianGNU/Linux システムにリモートログイン（遠隔ログイン）した場合にはＣＵＩ環境下での操作が基本になります。

以下の記述は「とりあえずインストール」した後、特にシステム設定変更などを行っていない状況を前提としています。そのような状況では、システム起動時に自動的にＧＵＩ環境（ GNOME ）となるようインストール時に自動設定されています。

【ログイン画面からのシャットダウン】

システム起動直後にディスプレイに現れるログイン画面の最下段に「言語（Ｌ）」、「セッション（Ｓ）」、「アクション（Ａ）」という３つが表示されています。この最後の「アクション（Ａ）」をクリックすると「アクションの選択」というタイトルのウィンドウが開きます。

「コンピュータの停止」を選択して「ＯＫ」ボタンをクリックするとシステムを停止できます。

「コンピュータの再起動」を選択して「ＯＫ」ボタンをクリックした場合には、DebianGNU/LINUX は一度シャットダウンされた後、自動的に起動されます。

【ログインしてからのシャットダウン】

コマンドを発行しながら操作を進めるには、デスクトップ画面上部のメニュー［デスクトップ］→［シャットダウン．．．］の順にクリックすると、画面中央に「このシステムをシャットダウンしますか？」と表示されます。

この表示が現れてから６０秒間なにも操作しなければ自動的にシャットダウンされます。

あるいは「ＯＫ」ボタンをクリックすると直ちにシャットダウンが始まります。「再起動」ボタンをクリックした場合には、一度シャットダウンされた後、自動的に起動されます。